Музей состоит из 3 залов, каждый из которых отражает историю края с древнейших времен до современности: зал истории, зал этнографии, зал исследователей Бурабая.

В «Зале истории» можно ознакомиться с особенностями хозяйственно-культурного уклада казахского общества, где представлены разделы: «Из истории Кокшетауского округа XIX века», «История региона в XX веке», «Заманауи Қазақстан».

В «Зале этнографии» представлены подлинные экспонаты домашнего обихода, этнокультура и народное прикладное творчество казахов. Издревле земля Кокшетау славилась творчеством выдающихся акынов края Акан серэ, Биржан сал, Укили Ибрай, чье творчество представлено также представлено в зале.

В «Зале исследователей Бурабая» посетители смогут познакомиться с деятельностью известных ученых, академиков и исследователей, внесших вклад в изучение истории и природы Бурабайского края. В годы Великой Отечественной войны видные деятели Академии наук СССР, более 150 ученых были эвакуированы в Акмолинскую область – это Владимир Вернадский, Лев Берг, Николай Гамалей и другие, чьи труды, книги представлены в музее. В современный период исследования по Бурабаю принадлежат А.Х.Маргулану, К.И.Сатпаеву, А.К.Казбекову, К.К.Абуеву.

Музей оборудован новыми информационными технологиями, установлены информационные киоски, моноблоки, телевизоры, где демонстрируются исторические документальные фильмы, проводятся интерактивные занятия по истории и этнографии Бурабая. В холле музея представлены картины художников Бурабайского района, отразивших красоту жемчужины Казахстана.